MOLEonline 2.0: Interactive Web-based Analysis of Biomacromolecular Channels

Logo poskytovatele
Logo poskytovatele
Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Fakultu sportovních studií, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

BERKA Karel HANÁK Ondřej SEHNAL David BANÁŠ Pavel NAVRÁTILOVÁ Veronika JAISWAL Deepti IONESCU Crina-Maria SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav OTYEPKA Michal

Rok publikování 2012
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Nucleic Acids Research
Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

Citace
www http://nar.oxfordjournals.org/content/40/W1/W222.full
Doi http://dx.doi.org/10.1093/nar/gks363
Obor Fyzikální chemie a teoretická chemie
Klíčová slova CYTOCHROMES P450; PROTEIN STRUCTURES; NUCLEIC-ACIDS; SUBSTRATE PREFERENCES; POTASSIUM CHANNEL; PHOTOSYSTEM-II; ACTIVE-SITES; IDENTIFICATION; TUNNELS; MACROMOLECULES
Popis Biomolecular channels play important roles in many biological systems, e.g. enzymes, ribosomes and ion channels. This article introduces a web-based interactive MOLEonline 2.0 application for the analysis of access/egress paths to interior molecular voids. MOLEonline 2.0 enables platform-independent, easy-to-use and interactive analyses of (bio)macromolecular channels, tunnels and pores. Results are presented in a clear manner, making their interpretation easy. For each channel, MOLEonline displays a 3D graphical representation of the channel, its profile accompanied by a list of lining residues and also its basic physicochemical properties. The users can tune advanced parameters when performing a channel search to direct the search according to their needs. The MOLEonline 2.0 application is freely available via the Internet at http://ncbr.muni.cz/mole or http://mole.upol.cz.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info