Variabilita DNA v okruhu Poa pratensis v České republice

Varování

Publikace nespadá pod Fakultu sportovních studií, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

STONEBERG HOLT Sierra Dawn HOROVÁ Lucie BUREŠ Petr

Rok publikování 2002
Druh Článek ve sborníku
Konference IXth Congress of the Czech Botanical Society / IX. Sjezd České botanické společnosti: Abstracts
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Botanika
Klíčová slova Flow cytometry; cpDNA; restriction analysis; trnL-trnF
Popis Analýza množství jaderné DNA průtokovou cytometrií a nekódující chloroplastové DNA pomocí restrikční analýzy potvrdila variabilitu DNA v okruhu Poa pratensis v rámci České republiky. Množství celkové jaderné DNA bylo určeno pro padesát dvě rostliny ze sedmnácti lokalit z České republiky, převážně z Moravy. Největší množství DNA obsahovalo sedm vzorků rostlin z okolí Chrudimi. Pomocí standartu (rostlina o známém váhovém množství DNA a zároveň s přesně určeným množstvím chromozomů) bylo množství jaderné DNA přepočteno na množství chromozomů a tímto byl jejich počet stanoven na šedesát osm až osmdesát jeden chromosom. Stejným postupem byl počet chromosomů určen u dalších vzorků. Čtrnáct rostlin z okolí Brna mělo podle výpočtů třicet jeden až padesát šest chromosomů. Dvě rostliny z Moravského krasu měly třicet dva chromosomy. Rostliny na jih od Brna měly všechny nízké množství jaderné DNA, které odpovídalo třiceti až čtyřiceti pěti chromosomům. Z toho lze usuzovat na možnost, že v Panonii mají zástupci okruhu Poa pratensis menší obsah jaderné DNA než v jiných oblastech. Pro další posouzení variability Poa pratensis bylo použito úseku chloroplastové DNA, kterým byla nekódující sekvence trnL intronu a trnL-trnF intergenového spaceru. Provedli jsme restrikční analýzu s použitím endonukleáz Alu I, BsaJ I a Bsm I. Jako vzor byly použity tři odrůdy, pocházející ze Šlechtitelské stanice Hladké Životice. U nich byly nalezeny tři typy této sekvence, které byly označeny písmeny MM, MS a HM. Ve sto dvaceti vzorcích pocházejících z Evropy, Severní Ameriky a Asie byly pak tyto tři typy nalezeny také plus jeden další, který se u vzorových kultivarů nevyskytoval. Celkový počet analyzovaných rostlin z České republiky byl dvacet tři, z toho sekvenci chloroplastové DNA typu MS měly rostliny z okolí Brna, jedna z okolí Chrudimi, dvě z jižních Čech, dále pak z Moravského krasu a z jižní Moravy. Sekvenci DNA typu MM měla jedna rostlina z Ostopovic u Brna a jedna z okolí Chrudimi. Konečně sekvenci DNA typu HM měla pouze jedna rostlina a to z Ivančic u Brna. Je zajímavé, že na tak poměrně malém území byly nalezeny téměř všechny typy, jako na různých místech severní polokoule. Nebyla nalezena souvislost mezi typem sekvence chloroplastové DNA a určeným množstvím jaderné DNA u dané rostliny.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info