OverProt: secondary structure consensus for protein families

Varování

Publikace nespadá pod Fakultu sportovních studií, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

MIDLIK Adam HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan CHARESHNEU Aliaksei BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

Rok publikování 2022
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Bioinformatics
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
www https://academic.oup.com/bioinformatics/article/38/14/3648/6604272
Doi http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btac384
Klíčová slova protein family; OverProt
Popis Every protein family has a set of characteristic secondary structures. However, due to individual variations, a single structure is not enough to represent the whole family. OverProt can create a secondary structure consensus, showing the general fold of the family as well as its variation. Our server provides precomputed results for all CATH superfamilies and user-defined computations, visualized by an interactive viewer, which shows the secondary structure element type, length, frequency of occurrence, spatial variability and beta-connectivity.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info