Project information
Evolution of genome size - a new role for the centromere drive
(Centrogenomtah)
- Project Identification
- GA20-15989S
- Project Period
- 1/2020 - 6/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
Jelikož mechanika buněčného dělení vyžaduje zachování poměru mezi velikostí chromosomů a kinetochorů, měly by změny ve velikosti kinetochoru být reflektovány velikostními změnami chromosomů (a v konečném důsledku i genomů). Přestože je centromerický tah („drajv“) široce akceptován jako mechanismus evoluce kinetochorů u eukaryot s asymetrickou meiózou, dopad tohoto tahu na evoluci velikosti chromosomů a velikosti genomu nebyl nikdy studován. S využitím karyologie (u mitotických metafází) a průtokové cytometrie (v interfázních jádrech) v kombinaci s imunofluorecenčním barvením proto hodláme fylogeneticky analyzovat, jak tempo v evoluci velikosti chromosomů a genomů koreluje s tempem evoluce velikosti kinetochorů a intenzitou pozitivní selekce v evoluci CenH3 napříč eukaryoty: u „drajvujících“ živočichů a semenných rostlin oproti „nedrajvujícím“ houbám, mechorostům, plavuním a kapradinám i na jemné fylogenetické škále v modelových Brassicaceae a Poaceae s jejichž využitím budou validovány a optimalizovány klíčové analytické techniky.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.
Publications
Total number of publications: 16
2022
-
Chromosome size matters: genome evolution in the cyperid clade
Annals of Botany, year: 2022, volume: 130, edition: 7, DOI
-
Kinetochore size scales with chromosome size in bimodal karyotypes of Agavoideae
Annals of Botany, year: 2022, volume: 130, edition: 1, DOI
-
Reference standards for flow cytometric estimation of absolute nuclear DNA content in plants
Cytometry: Part A, year: 2022, volume: 101, edition: 9, DOI
2021
-
Centromere Size Scales With Genome Size Across Eukaryotes
Scientific Reports, year: 2021, volume: 11, edition: 1, DOI
-
Holocentric Chromosomes Probably Do Not Prevent Centromere Drive in Cyperaceae
Frontiers in Plant Science, year: 2021, volume: 12, edition: February, DOI
2020
-
Is the evolution of carnivory connected with genome size reduction?
American Journal of Botany, year: 2020, volume: 107, edition: 9, DOI