Informace o projektu
Odhalení evolučních tajů lničky seté a příbuzných druhů
- Kód projektu
- GA21-03909S
- Období řešení
- 1/2021 - 12/2023
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Tribus Camelineae (Brassicaceae, brukvovité) je z vědeckého hlediska nejdůležitejší skupinou brukvovitých rostlin. Několik druhů huseníčků převratným způsobem změnilo experimentální rostlinnou biologii, zatímco lnička (Camelina) je ekonomicky nejvýznamnějším rodem tribu. Vzhledem k rostoucí důležitosti lničky jako olejnaté plodiny, je překvapivě málo známo o struktuře a evoluci genomu lniček. Podobně neprobádané zůstávají genomy druhů nejblíže příbuzných huseníčkům a lničkám. Plánujeme zkoumat vznik, strukturu a evoluci vybraných Camelineae genomů prostřednictvím srovnávacího malování chromosomů, genomového sekvenování a fylogenetické analýzy. Výstupy projektu budou zahrnovat (i) srovnávací cytogenomické mapy, (ii) objasněné rodičovství polyploidních genomů, (iii) robustní fylogenetický strom rodu Camelina, (iv) srovnání neznámých diploidních Camelina genomů na sekvenční a chromosomové úrovni, (v) nové objevy v evoluční historii polyploidního komplexu rodu Camelina, a (vi) struktury genomů potenciálně nových modelových druhů příbuzných huseníčku rolnímu.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 7
2023
-
An updated classification of the Brassicaceae (Cruciferae)
PHYTOKEYS, rok: 2023, ročník: 2023, vydání: 220, DOI
-
Cycles of satellite and transposon evolution in Arabidopsis centromeres
Nature, rok: 2023, ročník: 618, vydání: 7965, DOI
-
Global Brassicaceae phylogeny based on filtering of 1,000-gene dataset
Current Biology, rok: 2023, ročník: 33, vydání: 19, DOI
-
The evolution of the hypotetraploid Catolobus pendulus genome – the poorly known sister species of Capsella
Frontiers in Plant Science, rok: 2023, ročník: 14, vydání: May, DOI
2022
-
Chloroplast phylogenomics in Camelina (Brassicaceae) reveals multiple origins of polyploid species and the maternal lineage of C. sativa
Horticulture Research, rok: 2022, ročník: 9, vydání: January, DOI
-
The identification of the missing maternal genome of the allohexaploid camelina (Camelina sativa)
Plant Journal, rok: 2022, ročník: 112, vydání: 3, DOI
2021
-
The genetic and epigenetic landscape of the Arabidopsis centromeres
Science, rok: 2021, ročník: 374, vydání: 6569, DOI