Informace o projektu
Atomically resolved in vivo NMR spectroscopy as a novel tool for biological testing of therapeutically important genomic non-canonical DNA targets and their interactions with drugs in phenotypically diversified cancer cells.
- Kód projektu
- NV19-08-00450
- Období řešení
- 5/2019 - 12/2022
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu a vývoje na léta 2015 - 2022
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
- Odpovědná osoba Mgr Pavel Krejčí, Ph.D.
Postupy pro vývoj nových terapeutik proti neoplastickým onemocněním gastro-intesticinálního traktu a pankreatu jsou v současné době založeny na využívání modelových buněčných linií. Biologické parametry těchto buněčných linií se ovšem v mnoha důležitých aspektech odlišují od parametrů buněk v tzv. primárních neoplastických tkáních reálných pacientů. Ukazuje se, že nezahrnutí těchto rozdílů do procesu vývoje léčiv ve svém výsledku vede k tomu, že vyvinutá léčiva vykazují sníženou biologickou aktivitou v průběhu terapie a nebo jsou funkční jen pro velmi omezený okruh pacientů.
V rámci výzkumného projektu prováděného na našem pracovišti se snažíme, společně s výzkumnými týmy Lékařské fakulty a Středoevropského technologického institutu Masarykovy univerzity, vyvinout nové postupy pro stanovení vlivu vnitrobuněčného prostředí neoplastické tkáně na specifitu interakce mezi léčivem a molekulárním efektorem zprostředkovávajícím vlastní terapeutický účinek. Zároveň vyhodnocujeme potenciál využití těchto nových metod pro řízení léčebného postupu pro konkrétního pacienta.
Publikace
Počet publikací: 9
2023
-
A thermosensitive gel matrix for bioreactor-assisted in-cell NMR of nucleic acids and proteins
Journal of biomolecular NMR, rok: 2023, ročník: 77, vydání: 5-6, DOI
2022
-
Fluorine Labeling as a Versatile Tool for Probing Nucleic Acid Folding and Interactions by NMR Spectroscopy
ALDRICHIMICA ACTA, rok: 2022, ročník: 55, vydání: 2
2021
-
G-Quadruplex Formation by DNA Sequences Deficient in Guanines: Two Tetrad Parallel Quadruplexes Do Not Fold Intramolecularly
Chemistry - A European Journal, rok: 2021, ročník: 27, vydání: 47, DOI
-
Towards Profiling of the G-Quadruplex Targeting Drugs in the Living Human Cells Using NMR Spectroscopy
International Journal of Molecular Sciences, rok: 2021, ročník: 22, vydání: 11, DOI
2020
-
Composite 5-methylations of cytosines modulate i-motif stability in a sequence-specific manner: Implications for DNA nanotechnology and epigenetic regulation of plant telomeric DNA
BBA - General Subjects, rok: 2020, ročník: 1864, vydání: 9, DOI
-
Dual Targeting of BRAF and mTOR Signaling in Melanoma Cells with Pyridinyl Imidazole Compounds
Cancers, rok: 2020, ročník: 12, vydání: 6, DOI
-
HERMES - A Software Tool for the Prediction and Analysis of Magnetic-Field-Induced Residual Dipolar Couplings in Nucleic Acids
ChemPlusChem, rok: 2020, ročník: 85, vydání: 9, DOI
-
In-cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids
IN-CELL NMR SPECTROSCOPY: FROM MOLECULAR SCIENCES TO CELL BIOLOGY, rok: 2020, ročník: 21, vydání: 2020, DOI
-
Role of folding kinetics of secondary structures in telomeric G-overhangs in the regulation of telomere maintenance inSaccharomyces cerevisiae
Journal of Biological Chemistry, rok: 2020, ročník: 295, vydání: 27, DOI