Informace o projektu
Molekulární podstata pro specifické rozpoznávání histonu H3K4me2 pomocí Set3 PHD domény
- Kód projektu
- GA15-17670S
- Období řešení
- 1/2015 - 12/2017
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Komplex Set3 deacetylující histony v kombinaci s transkripcí nekódujících RNA dokáže zpozdit nebo utlumit indukci genů, což je důležité pro správné načasování transkripční odpovědi během aktivace nebo represe genů. Geny potlačené komplexem Set3 obsahují v promotorových regionech dimetylovaný lysin 4 na histonu H3 (H3K4me2) místo trimetylovaného lysinu 4 (H3K4me3). V současné době není známo jak H3K4me2 rekrutuje komplex Set3. Očekává se, že toto rozpoznávání se děje dosud nepopsaným mechanismem vzhledem k tomu, že Set3 PHD doména nemá klíčová rezidua tvořící aromatickou klec, která je zodpovědná za rozpoznávání metylovaných histonů. K odhalení neznámého rozpoznávacího mechanismu navrhujeme: (i) určit strukturu H3K4me2 v komplexu s Set3 PHD pomocí NMR spektroskopie, (ii) studovat důležitost interakce mezi H3K4me2 a Set3 PHD in vitro a in vivo. Navrhovaný výzkum poskytne zcela nové strukturní a funkční informace o rekrutování deacetylačního komplexu Set3, který byl nedávno ukázán jako důležitý regulátor struktury chromatinu a transkripce.
Publikace
Počet publikací: 3
2021
-
PHF3 regulates neuronal gene expression through the Pol II CTD reader domain SPOC
Nature Communications, rok: 2021, ročník: 12, vydání: 1, DOI
2019
-
Efficient and robust preparation of tyrosine phosphorylated intrinsically disordered proteins
BioTechniques, rok: 2019, ročník: 67, vydání: 1, DOI
2017
-
Characterization of novel bangle lectin from Photorhabdus asymbiotica with dual sugar-binding specificity and its effect on host immunity
PLoS Pathogens, rok: 2017, ročník: 13, vydání: 8, DOI