Relative expression of gammadelta T-cell receptor gene families detected by RT–PCR and capillary electrophoresis
| Název česky | relativní exprese gamadelta TCR genových rodin detekována pomocí RT-PCR a kapilární elektroforézy |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2012 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | International Journal of immunogenetics |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1744-313X.2012.01114.x/full |
| Doi | http://dx.doi.org/10.1111/j.1744-313X.2012.01114.x |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | Reverse transcription PCR; Capillary electrophoresis; gammadelta T cell; TCR; Vgamma and Vdelta gene families |
| Popis | Gamadelta T lymfocyty jsou předmětem intenzivního výzkumu, protože jejich funkce během infekcí, alergií, autoimunitních chorob, nádorů a po transplantacích není stále plně objasněna. Ke studiu Vgama a Vdelta genových rodin byly zavedeny techniky založené na PCR. Produkty PCR jsou běžně hodnoceny pomocí Southernova blotingu či CDR3 spektratypizace, ale rychlé a jednoduché zhodnocení exprese Vgama a Vdelta genových rodin chybí. Cílem naší studie bylo zhodnotit kapilární elektroforézu jako možný nástroj na zhodnocení populace gamadelta T lymfocytů. Tato práce poskytuje optimalizované podmínky PCR na amplifikaci gamadelta TCR. Dále popisuje využití kapilární elektroforézy na přístroji Agilent 2100 Bioanalyzer pro stanovení relativní exprese Vgama a Vdelta genových rodin po jejich amplifikaci. Tato metodika je aplikována na vzorky mononukleárních buněk periferní krve od pacientů při hemato-onkologické léčbě. Uvedená metodika je rychlá a snadná na provedení, a proto je vhodná na první vyšetření složení populace gamadelta T lymfocytů v cílové tkáni. |
| Související projekty: |