Studium polymorfizmů genu RGH1a spojeného s rezistencí k padlí travnímu u planých ječmenů
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2011 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | Genetická konference GSGM |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | mapping; SSR; RGH; powdery mildew; Blumeria graminis |
| Popis | Tři donory rezistence planého ječmene H. vulgare ssp. spontaneum byly studovány s cílem identifikace genů rezistence prostřednictvím genetického mapování a jejich další molekulární analýzy. Genetické mapování u populace F2 křížení náchylné odrůdy Tiffany a jednotlivých planých ječmenů umožnilo lokalizovat geny rezistence na chromozomu 1H, v blízkosti lokusu Mla. Tento lokus obsahuje tři genové rodiny RGH1, RGH2 a RGH3 sestávající z osmi rasově specifických genů. Lokus RGH1a byl u křížení Tiffany x PI466200 lokalizován 1cM od genu rezistence, jehož podíl na celkovém fenotypu rezistence je 95%. U křížení Tiffany x PI466495 byl gen rezistence lokalizován 2cM od genu RGH1a a efektivnost genu byla 84%. U křížení Tiffany x PI466510 nebyla zatím vazba mezi RGH1a a genem rezistence nalezena. Gen RGH1a byl sekvenován za účelem nalezení polymorfizmů vhodných pro vývoj DNA markerů. Primery pro sekvenování byly odvozeny ze sekvencí genu RGH1a (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Zjištěné polymorfizmy typu inzercí a delecí a jednonukleotidové polymorfizmy umožnily navržení markerů PCR-RFLP a alelově specifických markerů. Tyto markery umožnily jednak zpřesnění lokalizace identifikovaných genů rezistence, ale také provedení asociačních studií a sledování funkčních polymorfizmů způsobujících změnu nebo posun čtecího rámce. |
| Související projekty: |