Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2008 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Značná část genů zodpovědných za virulenci a rezistenci druhu Staphylococcus aureus je lokalizována na mobilních genetických elementech (MGE), které představují významnou složku genomu většiny kmenů. MGE tvoří obvykle 10-20 % genomu S. aureus a patří k nim bakteriofágy, ostrovy patogenity, plazmidy, chromozomové kazety a transpozony. U různých kmenů je přítomnost jednotlivých typů elementů velmi variabilní a je zdrojem genetického polymorfismu využitelného k jejich identifikaci. K bližší charakterizaci a detailní typizaci kmenů jsou MGE využívány především v lokálních epidemiologických studiích, kde pro vysokou míru genetické příbuznosti kmenů nejsou standardně používané metody (PFGE, spa-typizace) dostatečně citlivé. Detekce MGE je též důležitou doplňkovou metodou diagnostiky kmenů S. aureus, která umožňuje podrobnou charakteristiku izolátů z hlediska sledování šíření determinant virulence a rezistence k antibiotikům. V současnosti jsou nejvíce využívány metodiky založené na vyhledávání genů nesených na MGE pomocí PCR, které jsou finančně dostupné, dostatečně citlivé, časově a instrumentálně nenáročné. Pozornost je věnována především detekci specifických genů a sekvencí jednotlivých druhů bakteriofágů, plazmidů a u meticilin rezistentních kmenů (MRSA) také na charakterizaci typu chromozomové kazety SCCmec. |
| Související projekty: |