Bioinformatické vyhledávání lektinů z hub a plísní

Varování

Publikace nespadá pod Fakultu sportovních studií, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	KOMÁREK Jan MALINOVSKÁ Lenka WIMMEROVÁ Michaela
Rok publikování	2008
Druh	Článek ve sborníku
Konference	XXI. biochemický sjezd, program, sborník přednášek a posterů
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biochemie
Klíčová slova	lectins; bioinformatics;
Popis	Lektiny jsou proteiny nebo glykoproteiny neimunitního původu schopné rozpoznávat a reverzibilně vázat různé sacharidové struktury. Tato práce se zabývá bioinformatickým vyhledáváním a analýzou lektinů z hub a plísní. Na základě sekvenční podobnosti byly identifikovány houbové proteiny podobné známým lektinům. Pro nalezené potenciální lektiny a proteiny s lektinovou doménou byla predikována 3D struktura. Většina proteinů vykazovala strukturní podobnost s lektiny zařazenými do některé z rodin houbových lektinů (A. aurantia, C. cinereus, P. cornucopiae, F. velutipes a ricinová rodina) a je pravděpodobné, že se jedná o nové zástupce těchto rodin. Dále byly nalezeny houbové proteiny podobné lektinům z L. sulphureus, S. sclerotiorum a P. velutina a rostlinným mannosa-specifickým lektinům.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím