Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2007 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | XV. Moravsko-Slovenské mikrobiologické dni |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Mikrobiologie, virologie |
| Klíčová slova | rep-PCR; staphylococci |
| Popis | Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků. Nováková, D. Česká sbírka mikroorganismů, Masarykova univerzita Úvod. Rychlá a spolehlivá identifikace klinických izolátů představujících pro pacienta život ohrožující nebezpečí je stále aktuálnější. Výskyt a závažnost nozokomiálních, ale i běžných infekcí způsobených stafylokoky patří mezi jeden z nejsledovanějších problému dnešní mikrobiologie. Metodika. Zástupci devíti nejčastěji izolovaných a zároveň klinicky nejvýznamnější druhů a poddruhů stafylokoků člověka (S. aureus subsp. aureus, S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus, S. haemolyticus, S. saprophyticus subsp. saprophyticus, S. epidermidis, S. lugdunensis, S. warneri a S. simulans) pocházejících z různých typů materiálu byly podrobeny analýze repetitivních sekvencí za použití amplifikace s primery (GTG)5. Výsledky. Sluková analýza prokázala, že všechny druhy zahrnuté do studie tvoří druhově specifické, dobře odlišitelné rep-(GTG)5 profily. Nejvíce homogenní profily byly zjištěny u kmenů Staphylococcus lugdunensis (téměř 89%) a dále u kmenů Staphylococcus epidermidis (asi 70%). Nejvíce heterogenní profily byly naopak prokázány u kmenů Staphylococcus aureus subsp. aureus (kolem 40%). Shluková analýza zahrnující zástupce všech validně popsaných stafylokoků, však ukázala, že i přes poměrně nízkou podobnost profilů těchto izolátů, jsou tyto jasně odlišitelné od profilů ostatních taxonů. Dvojice poddruhů S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus a S. saprophyticus subsp. saprophyticus a typový kmen S. saprophyticus subsp. bovis netvořily poddruhově specifické profily a náležely do společných shluků. Závěr. Studie jasně prokázala vhodnost rep-(GTG)5 PCR pro rychlou a spolehlivou druhovou identifikaci klinicky významných stafylokoků. Práce byla částečně podpořena projektem MSM0021622416. |
| Související projekty: |