Isolation of polymerase chain reaction-ready bacterial DNA from Lake Baikal sediments by carboxyl-functionalised magnetic polymer microspheres

• Název česky: Izolace DNA v kvalitě vhodné pro PCR ze sedimentů Bajkalského jezera pomocí magnetických pomerních částic funkcionalizovaných karboxylovými skupinami
• Autoři: ŠPANOVÁ Alena; RITTICH Bohuslav; ŠTYRIAK Igor; ŠTYRIAKOVÁ Iveta; HORÁK Daniel
• Rok publikování: 2006
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Journal of Chromatography A
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Mikrobiologie, virologie
• Klíčová slova: Magnetic microspheres; P(HEMA-co-EDMA); Lake Baikal sediments; Microbial DNA Magnetic separation; Polymerase chain reaction (PCR)
• Popis: Magnetické neporézní poly(2-hydroxyethyl methakrylát-co-ethylen dimethakrylát) (P(HEMA-co-EDMA)) mikročástice byly použity k izolaci DNA z bajkalských sedimentů v kvalitě vhodné pro PCR. Výskyt falešně negativních výsledků v PCR byl způsoben přítomností extracelulárních inhibitorů ve vzorcích DNA. K jejich odstranění byla použita metoda reversibilní imobilizace DNA. DNA byla reversibilně adsorbována na mikročástice v přítomnosti 8,0% PEG 6000 a 2,0 m NaCl. Adsorbovaná DNA byla eluována TE pufrem o nízké iontové síle. Kvalita izolované DNA byla ověřována pomocí PCR.

Související projekty

• Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství