Paenibacillus mendelii sp. nov., a bacterium from surface-sterilized seeds of Pisum sativum L.

Varování

Publikace nespadá pod Fakultu sportovních studií, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Paenibacillus mendelii sp. nov., bakterie izolovaná z povrchově sterilizovaných semen hrachu setého (Pisum sativum L.)
Autoři	ŠMERDA Jakub SEDLÁČEK Ivo PÁČOVÁ Zdenka DURNOVÁ Eva SMÍŠKOVÁ Alexandra HAVEL Ladislav
Rok publikování	2005
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
www	http://ijs.sgmjournals.org/cgi/content/abstract/55/6/2351
Obor	Mikrobiologie, virologie
Klíčová slova	Paenibacillus mendelii; new taxa; 16S rRNA; DNA-DNA hybridization
Popis	Gram variabilní, fakultativně anaerobní bakterie tvořící endospory, byla izolována z povrchově sterilizovaných semen hrachu setého a charakterizována pomocí fenotypových a genotypových metod. PCR s primerem specifickými pro rod Paenibacillus (PAEN515F) a sekvence genu 16S rRNA indikovala, že kmen C/2T náleží do rodu Paenibacillus a je blízce příbuzný druhu Paenibacillus phyllosphaerae (94,O % podobnost sekvencí). Kmen C/2T vytváří jedinečné fenotypové profily, především v produkci kyseliny ze substrátů. Obsah guaninu a cytozinu (50,8 mol%) a převažující mastná kyselina (anteiso-C15 : 0) odpovídají charakterizaci rodu Paenibacillus. DNA-DNA hybridizace odlišuje kmen C/2T od ostatních, fylogeneticky příbuzných druhů rodu Paenibacillus a proto byl kmen C/2T (=CCM 4839T=LMG 23002T) popsán jako nový druh Paenibacillus mendelii.
Související projekty:	Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase