Štúdium nukleových kyselín v podchladenej vode pomocou NMR metód.
| Název česky | Studium nukleových kyselin v podchlazené vodě pomocí NMR metod. |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | Sborník abstraktů, Studentská vědecká konference v oboru chemie a biochemie |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Biochemie |
| Klíčová slova | NMR;DNA;structure |
| Popis | Krátke DNA oligonukloetidy, tzv. hairpins zohrávajú významnú úlohu v mnohých biologických procesoch. Najzaujímavejšou črtou takýchto biomolekúl o sekvencii d(GCGNAGC) (N = A, G, C, T) je ich výnimočná stabilita, reprezentovaná vysokou teplotou topenia, zvýšenou pohyblivosťou v polyakrylamidových géloch a odolnosťou voči nukleázam. Vyriešenie ich štruktúr nám pomáha lepšie pochopiť tieto jedinečné vlastnosti. Predčasom bola vyriešená štruktúra DNA oligonukleotidu so sekvenciou d(GCGAAGC) metódami NMR spektroskopie za použitia medziprotónových vzdialeností získaných z NOESY experimentov, torzných uhlov a zvyškových dipolárnych interakčných konštánt. Cieľom tohoto projektu je nový výpočet štruktúry uvedenej molekuly, ktorý je založený na použití medziprotónových vzdialeností z NOESY experimentov, zmeraných v podchladenej vode. V takýchto podmienkach sa intramolekulárne pohyby a chemická výmena protónov aminoskupín výrazne inhibujú. Tento prístup nám, v porovnaní so štúdiami pri izbovej teplote, umožňuje získať vačší počet medziprotónových vzdialeností vymeniteľných protónov, nevyhnutných pre náasledný výpočet štruktúry molekuly. |
| Související projekty: |