Klasifikace komplexu <I>Staphylococcus sciuri</I> z humánního klinického materiálu
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Správy klinickej mikrobiológie |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | Staphylococcus sciuri; molecular epidemiology; methicillin resistance |
| Popis | Koaguláza negativní stafylokoky jsou běžnou součástí mikroflóry kůže i kožních žláz teplokrevných živočichů včetně člověka, ale mohou se též podílet na vzniku různých infekčních onemocnění, a to především u oslabených jedinců. Z humánního klinického materiálu jsou občas izolováni zástupci komplexu Staphylococcus sciuri, původně spojovaní pouze s výskytem u živočichů, případně v potravinách. Druh S. sciuri má význam i hlediska přítomnosti homologu genu mecA, považovaného za předchůdce genu pro rezistenci k meticilinu neseného kmeny MRSA. V naší studii jsme pomocí ribotypizace, PCR a biotypizace analyzovali 72 humánních izolátů komplexu S. sciuri spolu s 6 referenčními typovými kulturami. Ribotypizace byla prováděna restrikčním enzymem EcoRI a sondou komplementární s 16S a 23S rRNA, vyhodnocení ribotypů bylo pomocí programu GelCompar II. K biotypizaci byly použity soupravy API Staph a ID 32 Staph včetně některých klíčových konvečních testů a dále analýza profilu celobuněčných proteinů (1D SDS-PAGE). Biochemická identifikace izolátů komplexu S. sciuri založená na výsledcích komerčních souprav byla často nejednoznačná a vyžadovala provedení dodatečných testů. U všech izolátů a referenčních kmenů byla metodou PCR prokázána přítomnost genu mecA. Dva izolázy (P602 a P607) nesly dvě různé kopie genu mecA. U 55 izolátů byl gen mecA podrobně typizován metodou PCR-RFLP s restrikčním enzymem MseI. Tato analýza odhalila přítomnost 5 různých RFLP profilů, které nekorelovaly s taxonomickým zařazením kmenů. Všechny izoláty i referenční kmeny byly jednoznačně navzájem odlišitelné svými ribotypy, a to až na úroveň podruhu. Fenotypově velmi podobné druhy S. sciuri a S. lentus byly odlišeny jak ribotypizací, tak i analýzou SDS-PAGE a obě tyto metodiky umožňují spolehlivou identifikaci S. lentus. Izoláty druhu S. sciuri se na základě svých EcoRI hybridizačních profilů vyčlenily do šesti skupin taxonomicky reprezentujících jednotlivé poddruhy, zatímco výsledky SDS-PAGE u téhož souboru jsou obecně použitelné pouze pro typizaci kmenů navzájem mezi sebou. Toto studium kmenů humánního původu ukázalo nižší použitelnost komerčních identifikačních souprav či SDS-PAGE metody pro vnitrodruhovou identifikaci komplexu S. sciuri. Výsledky ribotypizace jednoznačně prokázaly výskyt taxonů S. lentus, S. sciuri subsp. sciuri, S. sciuri subsp. carnaticus a S. sciuri subsp. rodentium v humánním klinickém materiálu. Ribotypizace je tak vhodným nástrojem pro odlišení taxonů komplexu S. sciuri. |
| Související projekty: |