Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays

Varování

Publikace nespadá pod Fakultu sportovních studií, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	SMITALOVÁ Dagmar DVORAKOVA D. RÁČIL Zdeněk ROMŽOVÁ Marianna
Rok publikování	2021
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Practical Laboratory Medicine
Fakulta / Pracoviště MU	Středoevropský technologický institut
Citace
www	https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235255172100010X?via%3Dihub
Doi	http://dx.doi.org/10.1016/j.plabm.2021.e00210
Klíčová slova	Chronic myeloid leukemia; BCR-ABL1 monitoring; GeneXpert BCR-ABL Monitor assay; RT-qPCR; Digital PCR
Popis	BCR-ABL1 molecular detection using quantitative PCR (qPCR) methods is the golden standard of chronic myeloid leukemia (CML) monitoring. However, due to variable sensitivity of qPCR assays across laboratories, alternative methods are tested. Digital PCR (dPCR) has been suggested as a robust and reproducible option. Here we present a comparison of droplet dPCR with routinely used reverse-transcription qPCR (RT-qPCR) and automated GeneXpert systems. Detection limit of dPCR was above 3 BCR-ABL1 copies, although due to background amplification the resulting sensitivity was 0.01% BCR-ABL1 (MR4.0). Nevertheless, in comparison with GeneXpert, dPCR categorized more than 50% of the patients into different MR groups, showing a potential for improved BCR-ABL1 detection.
Související projekty:	Mutační analýza primitivních buněčných populací u chronické myeloidní leukémie: za hranicí BCR-ABL1 Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VI Nové přístupy ve výzkumu, diagnostice a terapii hematologických malignit VII