Představení xMAP technologie a možností jejího využití
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2016 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Přiložené soubory | |
| Popis | Jednou z technologií umožňující multiplexní analýzu vzorků je xMAP technologie (x=analyte, MAP=Multi Analyte Profiling). xMAP technologie je založena na kombinaci existujících laboratorních metod jako jsou PCR, průtoková cytometrie a ELISA a umožňuje detekci a kvantifikaci více než 100 různých analytů (nukleových kyselin nebo proteinů) současně v průběhu jedné reakce. xMAP technologie využívá polystyrenové fluorescenčně barvené mikrokuličky, které na svém povrchu obsahují ligandy, ke kterým se poté váže specifický analyt ze vzorku. Pro detekci a kvantifikaci analytu slouží přístroje měřící fluorescenci reportérového fluoroforu. Podle typu detekovaného analytu je xMAP technologie využívána k identifikaci různých analytů. Pro multiplexní detekci a kvantifikaci nukleových kyselin ve vyšetřovaných vzorcích pomocí xMAP technologie je možné použít metody založené na DNA hybridizaci, kompetitivní DNA hybridizaci, sekvenčně specifické enzymatické reakci, oligonukleotidové ligační reakci (oligonucleotide ligation assay=OLA), multiplexní oligonukleotidové ligační PCR reakci (multiplex oligonucleotide PCR assay=MOL-PCR), alelově specifickém prodlužování primerů (allele-specific primer extension=ASPE) nebo jedno-bázovém prodlužování řetězce (single base chain extension=SBCE). Tyto metody lze aplikovat např. pro sledování genové exprese, analýzu microRNA (mRNA), detekci jedno-nukleotidových polymorfismů (SNP), detekci specifických sekvencí nebo sledování genů podílejících se na vzniku geneticky podmíněných onemocnění. Multiplexní detekce a kvantifikace proteinů ve vyšetřovaných vzorcích pomocí xMAP technologie umožňuje např. stanovení koncentrace cílových proteinů (enzymů, protilátek, cytokinů, krevních antigenů, hormonů) ve vyšetřovaných vzorcích. Tato technologie tak představuje alternativu místo běžně používaných metod jako je např. ELISA. V oblasti bezpečnosti potravin lze xMAP technologii uplatnit při detekci a kvantifikaci významných alimentárních patogenů zahrnujících nejenom bakterie, ale také viry a parazity. Jejich detekce a kvantifikace může být založena na průkazu nukleových kyselin, ale také proteinů, sacharidů, bakteriálních toxinů a jiných makromolekul. xMAP technologie tedy přináší do rutinní analýzy vzorků možnost velmi rychlé identifikace obrovského počtu různorodých cílů v průběhu jedné reakce za velmi krátkou dobu a za použití velmi malého množství vstupního materiálu. Mezi další obrovské výhody xMAP technologie se řadí její uživatelsky jednoduchá modifikovatelnost a také velké množství komerčně dostupných xMAP detekčních souprav. |
| Související projekty: |