Project information
Structural basis for co-transcriptional nucleosome reassembly mediated by Spt6
- Project Identification
- GA22-19896S
- Project Period
- 1/2022 - 12/2024
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Elongační faktor Spt6 interaguje s RNA polymerázou II (Pol II) a působí jako histonový chaperon, který podporuje opětovné sestavení nukleosomů po průchodu polymerázy. Přesný mechanismus opětovného sestavení nukleosomů zprostředkovaný faktorem Spt6 zůstává nejasný. Navrhujeme studovat opětovné sestavení nukleosomů zprostředkované Spt6 kombinací kryoelektronové mikroskopie (kryo-EM) a biochemických přístupů. Budeme zkoumat strukturní podstatu autoinhibice a aktivace faktoru Spt6, který je zprostředkován jeho N-terminální oblastí a dále jak Spt6 interaguje s histony a nukleosomem. Dále budeme studovat v definovaném biochemickém systému, jak Spt6 spolupracuje s dalšími elongačními faktory Spt4/5 a Pol II, což vede účinnému sestavení nukleosomů, a také určíme strukturu transkripčního komplexu Pol II–Spt4/5–nukleosom navázaným na Spt6 pomocí kryo-EM. Naše studie odhalí roli důležitosti spolupráce mezi vnitřně neuspořádanými a strukturovanými oblastmi Spt6, které regulují vazbu na nukleosom a Pol II, a opětovné sestavení nukleosomů.
Publications
Total number of publications: 3
2024
-
Assembly of the Xrn2/Rat1–Rai1–Rtt103 termination complexes in mesophilic and thermophilic organisms
Structure, year: 2024, volume: 33, DOI
2022
-
Cooperation between intrinsically disordered and ordered regions of Spt6 regulates nucleosome and Pol II CTD binding, and nucleosome assembly
Nucleic acids research, year: 2022, volume: 50, edition: 10, DOI
-
Structural and functional basis of mammalian microRNA biogenesis by Dicer
Molecular Cell, year: 2022, volume: 82, edition: 21, DOI