Project information
Molecular architecture of ADAR - RNA complexes
- Project Identification
- GA18-11397S
- Project Period
- 1/2018 - 12/2020
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Adenosin deaminasy které působí na RNA (ADAR) specificky modifikují adenosiny na inosiny v RNA, což překódovává genomickou informaci. Nedávné studie poskytly strukturní data o tom jak se jednotlivé izolované domény ADARu (dsRNA vazebná doména a katalytická doména) vážou na RNA. Nicméně není známá celková struktura komplexu ADAR-RNA, ve které je klíčová souhra a interakce jednotlivých domén ADARu při vazbě na RNA, což definuje editační specificitu enzymu ADAR. Navrhujeme určit celkovou strukturu komplexu ADAR2 s GluR-2 R/G pre-mRNA and ADAR1 s NEIL1 pre-mRNA pomocí kryo-elektronové mikroskopie. Navrhovaný výzkum poskytne zcela nové strukturní informace o celkové architektuře komplexů ADAR-RNA a dešifruje jak si ADAR vybírá specifické adenosiny k deaminaci.
Publications
Total number of publications: 3
2020
-
Termination of non-coding transcription in yeast relies on both an RNA Pol II CTD interaction domain and a CTD-mimicking region in Sen1
EMBO Journal, year: 2020, volume: 39, edition: 7, DOI
-
Yeast Spt6 Reads Multiple Phosphorylation Patterns of RNA Polymerase II C-Terminal Domain In Vitro
Journal of Molecular Biology, year: 2020, volume: 432, edition: 14, DOI
2019
-
Efficient and robust preparation of tyrosine phosphorylated intrinsically disordered proteins
BioTechniques, year: 2019, volume: 67, edition: 1, DOI