Project information
Analýza klonální heterogenity chronické lymfocytární leukemie pomoci sekvenování nové generace genu pro B-buněčný receptor. Národní studie

Information

This project doesn't include Faculty of Sports Studies. It includes Central European Institute of Technology. Official project website can be found on muni.cz.

Project Identification

15-30015A (kod CEP: NV15-30015A)

Project Period

5/2015 - 12/2018

Investor / Pogramme / Project type

Ministry of Health of the CR

Ministry of Health Research Programme 2015 - 2022

MU Faculty or unit

Central European Institute of Technology

prof. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D.

Cooperating Organization

University Hospital Brno-Bohunice

Responsible person Prof. MUDr. Michael Doubek, Ph.D.

Chronická lymfocytární leukémie (CLL) se vyznačuje vysokou heterogenitou klinického průběhu a molekulárních vlastností maligních B lymfocytů. CLL má klonální charakter a díky tomu je možné popsat každý případ CLL jedinečnou přestavbou imunoglobulinových genů (IG), kódující B buněčný receptor. Publikované molekulárně-biologické analýzy dokládají význam antigenní stimulace u CLL, což je podpořeno také výsledky epidemiologických studií. Vysokokapacitní sekvenační technologie dosud nebyly široce využívány ve výzkumu IG kvůli řadě metodických nedostatků. Navrhovaný projekt si klade za cíl zavést moderní technologii vysokokapacitního sekvenování IG a provést národní screening nově diagnostikovaných CLL pacientů. Data generovaná pomocí sekvenování budou podrobně studována ve vztahu ke klinickému průběhu CLL, laboratorním parametrům a epidemiologickým nálezům. Abychom dosáhli vytyčených cílů, hodláme provést epidemiologickou studii nově diagnostikovaných CLL na národní úrovni. Jako prostředek plnění cílů také využijeme a dále rozšíříme národní databázi CLL pacientů CLLEAR.

Publications

Total number of publications: 44

2018

Evolution of genomic abnormalities during CLL disease course is associated with telomere length changes

OLBERTOVÁ Helena PLEVOVÁ Karla MALČÍKOVÁ Jitka KOTAŠKOVÁ Jana PAVLOVÁ Šárka ŠPUNAROVÁ Michaela TRBUŠEK Martin NAVRKALOVÁ Veronika KANTOROVÁ Barbara BRYCHTOVÁ Yvona PANOVSKÁ Anna DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

Conference abstract

Year: 2018, type: Conference abstract
Multiple productive IGH rearrangements denote oligoclonality even in immunophenotypically monoclonal CLL

BRÁZDILOVÁ Kamila PLEVOVÁ Karla SKUHROVÁ FRANCOVÁ Hana OLBERTOVÁ Helena BORSKÝ Marek BIKOS Vasileios MALČÍKOVÁ Jitka OLTOVÁ Alexandra KOTAŠKOVÁ Jana TICHÝ Boris BRYCHTOVÁ Yvona MAYER Jiří DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

Article in Periodical

Leukemia, year: 2018, volume: 32, edition: 1, DOI
No improvement in long-term survival over time for chronic lymphocytic leukemia patients in stereotyped subsets 1 and 2 treated with chemo(immuno)therapy

BALIAKAS P. MATTSSON M. HADZIDIMITRIOU A. MINGA E. AGATHANGELIDIS A. SUTTON L.A. SCARFO L. DAVIS Z. YAN X.J. PLEVOVÁ Karla SANDBERG Y. VOJDEMAN F.J. TZENOU T. CHU C.C. VERONESE S. MANSOURI L. SMEDBY K.E. GIUDICELLI V. NGUYEN-KHAC F. PANAGIOTIDIS P. JULIUSSON G. ANAGNOSTOPOULOS A. LEFRANC M.P. TRENTIN L. CATHERWOOD M. MONTILLO M. NIEMANN C.U. LANGERAK A.W. POSPÍŠILOVÁ Šárka STAVROYIANNI N. CHIORAZZI N. OSCIER D. JELINEK D.F. SHANAFELT T. DARZENTAS Nikos BELESSI C. DAVI F. GHIA P. ROSENQUIST R. STAMATOPOULOS K.

Article in Periodical

haematologica, year: 2018, volume: 103, edition: 4, DOI
Promoter methylation of ROR1 ligand WNT5A associates with its expression in CLL

POPPOVÁ Lucie JANOVSKÁ Pavlína GONZALEZ B. PLEVOVÁ Karla BYSTRÝ Vojtěch PÁL Karol PLEŠINGEROVÁ Hana BORSKÝ Marek KOTAŠKOVÁ Jana DUMBOVIC G. BIAYNA J. MORENO JM. MORALEDA CM JANSEN S. BRYCHTOVÁ Yvona DOUBEK Michael PAVLOVÁ Šárka ALONSO S. BRYJA Vítězslav POSPÍŠILOVÁ Šárka

Conference abstract

Year: 2018, type: Conference abstract
Reproducible diagnosis of chronic lymphocytic leukemia by flow cytometry: An European Research Initiative on CLL (ERIC) & European Society for Clinical Cell Analysis (ESCCA) Harmonisation project

RAWSTRON A.C. KREUZER K.A. SOOSAPILLA A. SPACEK M. STEHLÍKOVÁ Olga GAMBELL P. MCIVER-BROWN N. VILLAMOR N. PSARRA K. ARROZ M. MILANI R. DE LA SERNA J. CEDENA M.T. JAKSIC O. NOMDEDEU J. MORENO C. RIGOLIN G.M. CUNEO A. JOHANSEN P. JOHNSEN H.E. ROSENQUIST R. NIEMANN C.U. KERN W. WESTERMAN D. TRNENY M. MULLIGAN S. DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka HILLMEN P. OSCIER D. HALLEK M. GHIA P. MONTSERRAT E.

Article in Periodical

Cytometry Part B ( Clinical cytometry), year: 2018, volume: 94, edition: 1, DOI
Terapie chronické lymfocytární leukemie v roce 2018

DOUBEK Michael

Article in Proceedings

Transfuze a hematologie dnes, year: 2018
ToTem: a tool for variant calling pipeline optimization

TOM Nikola TOM O. MALČÍKOVÁ Jitka PAVLOVÁ Šárka KUBEŠOVÁ Blanka RAUSCH T. KOLARIK M. BENES V. BYSTRÝ Vojtěch POSPÍŠILOVÁ Šárka

Article in Periodical

BMC Bioinformatics, year: 2018, volume: 19, edition: JUN, DOI
Tracking minor clones in chronic lymphocytic leukemia using high-throughput immunoprofiling

STRÁNSKÁ Kamila PLEVOVÁ Karla SKUHROVÁ FRANCOVÁ Hana BIKOS Vasileios JELÍNKOVÁ Hana ZAPLETALOVÁ Eva MAMEDOV Ilgar REIGL Tomáš DARZENTAS Nikos DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

Conference abstract

Year: 2018, type: Conference abstract
Tracking the minor clones in oligoclonal chronic lymphocytic leukemia using high-throughput immunoprofiling

STRÁNSKÁ Kamila PLEVOVÁ Karla SKUHROVÁ FRANCOVÁ Hana OLBERTOVÁ Helena BIKOS Vasileios JELÍNKOVÁ Hana ZAPLETALOVÁ Eva MAREČKOVÁ Andrea KOTAŠKOVÁ Jana TICHÝ Boris KOMKOV A. NUGMANOV G. MAMEDOV Ilgar REIGL Tomáš DARZENTAS Nikos ŠKABRAHOVÁ Hana BRYCHTOVÁ Yvona PANOVSKÁ Anna MAYER Jiří DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

Conference abstract

Year: 2018, type: Conference abstract

2017

Analýza genetických změn CLL nemocných s vývojem resistence k léčbě inhibitorem BTK

JAROŠOVÁ Marie KOTAŠKOVÁ Jana PLEVOVÁ Karla MALČÍKOVÁ Jitka BRYCHTOVÁ Yvona ONDRUŠKOVÁ E. ĎURECHOVÁ E. DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

Conference abstract

Year: 2017, type: Conference abstract