Project information
Zásadní význam fosforylace YS. Studium interakce mezi CTD a transkripčním elongačním faktorem Spt6
- Project Identification
- GA15-24117S
- Project Period
- 1/2015 - 12/2017
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Histonový chaperon Spt6 je vysoce konzervovaný protein, který se účastní procesů transkripční elongace, spravování chromatinu a zpracování mRNA. Spt6 je potřebná k vazbě RNA procesních faktorů na RNA polymerázu II (RNAPII) ve fázi transkripční elongace. Flexibilní C-terminální doména RNAPII (CTD) je rozpoznávána tandemovou SH2 doménou proteinu Spt6. Změny ve fosforylaci na CTD s kozervovanou repeticí heptapetidu Y1S2P3T4S5P6S7 kontrolují během transkripčního cyklu vazbu transkripčních a mRNA procesních faktorů na RNAPII. Nedávno bylo ukázáno, že fosforylace na pozici Y1 podporuje vazbu elongačního faktoru Spt6. V předkládaném projektu navrhujeme použití nukleární magnetické rezonance (NMR), dynamické analýzy transkriptomu (DTA) a fluorescenční anizotropie (FA) k pochopení klíčových molekulárních a strukturních vlastností, které ovlivňují interakci mezi Spt6 a specificky fosforylovanou CTD in vivo a in
vitro.
Publications
Total number of publications: 3
2019
-
Treatment of Surface Plasmon Resonance (SPR) Background in Total Internal Reflection Ellipsometry: Characterization of RNA Polymerase II Film Formation
APPLIED SPECTROSCOPY, year: 2019, volume: 73, edition: 3, DOI
2017
-
Structural insight into recognition of phosphorylated threonine-4 of RNA polymerase II C-terminal domain by Rtt103p
EMBO reports, year: 2017, volume: 18, edition: 6, DOI
-
Structure and dynamics of the RNAPII CTDsome with Rtt103
Proceeding of the National Academy of Sciences of the USA, year: 2017, volume: 114, edition: 42, DOI