Project information
Studium kódu CTD RNA polymerázy II
- Project Identification
- GA13-18344S (kod CEP: GA13-18344S)
- Project Period
- 2/2013 - 12/2017
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Navrhuji objasnit základní pravidla, která používají RNA procesující faktory pro rozpoznávání tzv. CTD kódu RNA polymerázy II. Koncept CTD kódu, který urcuje pozici RNA polymerázy v transkripcním cyklu a rídí interakce se specifickými procesujícími
faktory byl navrhnut témer pred 10 lety. Snaha odhalit strukturu CTD a její interakce s cetnými vazebnými faktory byla neúspešná v predchozích krystalografických pokusech z duvodu flexibility CTD a její slabé vazebné afinite k procesujícím
faktorum. V tomto projektu urcíme NMR struktury nekolika procesujících faktoru navázaných na CTD s ruznými modifikacními znackami. Nedávný vývoj v oblasti SAXS technik, které lze nyní kombinovat s vysoce rozlišenými NMR strukturami, nám umožní
objasnit dlouhodobou otázku jak vazba procesujících faktoru mení strukturu CTD. Použití této technologie poskytne zcela nové strukturní informace k objasnení CTD kódu, což významne posune hranice poznání v oboru transkripce a procesování RNA.
Publications
Total number of publications: 3
2017
-
Structural insight into recognition of phosphorylated threonine-4 of RNA polymerase II C-terminal domain by Rtt103p
EMBO reports, year: 2017, volume: 18, edition: 6, DOI
-
Structure and dynamics of the RNAPII CTDsome with Rtt103
Proceeding of the National Academy of Sciences of the USA, year: 2017, volume: 114, edition: 42, DOI
2014
-
Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation
Molecular Cell, year: 2014, volume: 55, edition: 3, DOI